Şeyh Camii, Muğla'da 16. yüzyıl Osmanlı dönemine ait cami.

Şehrin aynı isimli Şeyh mahallesinde bulunan cami, 1565 yılında Şeyh Bedrettin tarafından yaptırılmıştır. Bu nedenle Osmanlı kayıtlarında camiden 'Şeyh Bedrettin Camii' olarak bahsedilmektedir. Pek çok kez tadilattan geçen camiye minare 1800'lü yıllarda eklenmiştir. Caminin haziresinde başta caminin banisi Şeyh Bedrettin olmak üzere ulemadan bazı kişilerin mezarları bulunmaktadır. 1754 ve 1756 tarihli kayıtlarda cami bahçesinde iki hücreli bir medrese bulunduğu belirtilir. Kayıtta 'Hacı Ömer ve Hacı Ali Medreseleri' olarak geçen bu medreselere üç dersiam ataması yapılmıştır.

1671 yılında şehre gelen Evliya Çelebi Muğla'daki sanatlı camilerin arasında Şeyh Camisini de saymaktadır. Osmanlı hurufat defterlerinde camiye dair 1700-1831 tarihleri arasında 46'ya yakın atama kaydı bulunmaktadır ki Muğla camileri arasında en çok kayıt bu camiye aittir.

Günümüzde ibadete açık olan caminin bahçesinde müftülüğe bağlı Muğla Kız Kur'an Kursu bulunur.

Şeyh Bedrettin
Camiyi yaptıran Şeyh Bedrettin 16. yüzyılda yaşamış bir mutasavvıftır. Muğla'da Kadı Mescidi olarak bilinen medresede ders okutmuştur. 16. yüzyıla ait kayıtlarda bu alimin adının bir mahalleye verilmesi nedeniyle büyük şöhret sahibi olduğu anlaşılmaktadır fakat yazılı kaynaklarda hakkında fazla bir bilgi yoktur.​